Brysselissä on kolme tärkeintä kaukoliikenteen juna-asemaa, jotka ovat kaikki pohjos-eteläsuunnassa kaupungin keskustan läpi kulkevan linjan varrella. Asemat ovat järjestyksessä pohjoisesta etelään Nord, Centrale ja Midi (ranskalaiset nimet).
Bruxelles-Nord
Bruxelles-Nord (ranskaksi) tai Brussel-Noord(hollanniksi) on Brysselin pohjoinen rautatieasema. Se sijaitsee Schaerbeekin alueen eteläreunalla korkeiden toimistorakennusten juurella. Sen vierestä kulkevat myös raitiovaunulinjat 3 ja 4. Parisataa metriä aseman eteläpuolella on lähin metroasema Rogier.
Bruxelles Central
Bruxelles Central (ranskaksi) tai Brussel-Zuid(hollanniksi) on Brysselin ydinkeskustan juna-asema ja juna-aseman yhteydessä on myös samanniminen metroasema.
Bruxelles-Midi
Bruxelles-Midi (ranskaksi) tai Brussel-Zuid( hollanniksi) on Brysselin eteläinen päärautatieasema. Juna-aseman yhteydessä on myös metroasema.